More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5006 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  84.29 
 
 		 650 aa  1033    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  84.29 
 
 		 650 aa  1033    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 634 aa  1269    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  85.6 
 
 		 641 aa  1041    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  90.87 
 
 		 633 aa  1149    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  56.88 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  56.99 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 604 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  45.95 
 
 		 612 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  52 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  48.69 
 
 		 631 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  51.65 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  47.69 
 
 		 589 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  42.76 
 
 		 602 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  43.12 
 
 		 632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.63 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.57 
 
 		 612 aa  357  5e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 581 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.16 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.16 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 		 578 aa  326  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.44 
 
 		 1321 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.88 
 
 		 601 aa  316  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.65 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.71 
 
 		 1522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.78 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 593 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.58 
 
 		 1284 aa  303  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.34 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31 
 
 		 584 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.29 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 		 589 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.27 
 
 		 586 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.37 
 
 		 641 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.25 
 
 		 592 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  28.87 
 
 		 581 aa  298  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 1194 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.21 
 
 		 601 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 		 586 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.44 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.74 
 
 		 586 aa  296  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.64 
 
 		 642 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.3 
 
 		 587 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.33 
 
 		 614 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.65 
 
 		 607 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  32.14 
 
 		 589 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.32 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 636 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.67 
 
 		 586 aa  293  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.67 
 
 		 586 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  30.71 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.51 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.49 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.32 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.69 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.51 
 
 		 608 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.67 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.33 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.28 
 
 		 594 aa  287  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.13 
 
 		 1436 aa  286  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 628 aa  286  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.78 
 
 		 556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  29.93 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.02 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.06 
 
 		 768 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.07 
 
 		 586 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.77 
 
 		 609 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  31.21 
 
 		 614 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  33.94 
 
 		 1301 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 650 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.44 
 
 		 760 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.06 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.29 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 658 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.22 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.67 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  32.86 
 
 		 648 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.67 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.7 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  32.63 
 
 		 660 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  34.39 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.46 
 
 		 586 aa  281  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.26 
 
 		 773 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.44 
 
 		 580 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.77 
 
 		 593 aa  280  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.76 
 
 		 618 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.66 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  30.03 
 
 		 589 aa  280  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  31.39 
 
 		 632 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.76 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.28 
 
 		 617 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.76 
 
 		 619 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.34 
 
 		 1257 aa  277  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>