More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1321 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  62.43 
 
 		 194 aa  241  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  60.64 
 
 		 192 aa  240  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  54.24 
 
 		 190 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  53.14 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.26 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  52.27 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  51.7 
 
 		 187 aa  201  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  51.7 
 
 		 187 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  49.72 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  52.27 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.68 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.62 
 
 		 195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  51.85 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  52.25 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  53.11 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.62 
 
 		 191 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  51.03 
 
 		 189 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  44.62 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.68 
 
 		 176 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.07 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  43.17 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.78 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.26 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.26 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.46 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  38.55 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.91 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  29.38 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  25.51 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  26.18 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.74 
 
 		 769 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  25.95 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  35.85 
 
 		 767 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.57 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  30.66 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  34.04 
 
 		 819 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  36.26 
 
 		 787 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  35.85 
 
 		 772 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 787 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 787 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  30.7 
 
 		 821 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 787 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  37.14 
 
 		 758 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  35.16 
 
 		 784 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  34.07 
 
 		 799 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 813 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 779 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 779 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  34.29 
 
 		 774 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 779 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  34.04 
 
 		 801 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  30.19 
 
 		 387 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1463  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.09 
 
 		 698 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  32.98 
 
 		 828 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  29.87 
 
 		 771 aa  52  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  29.87 
 
 		 770 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  33.33 
 
 		 785 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  32 
 
 		 818 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  35.71 
 
 		 762 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  31.4 
 
 		 705 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  35.62 
 
 		 814 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  36.29 
 
 		 743 aa  51.6  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.27 
 
 		 694 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  32.47 
 
 		 770 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  32.14 
 
 		 385 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0686  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.05 
 
 		 768 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  34.74 
 
 		 416 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  35.29 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.96 
 
 		 411 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  30.67 
 
 		 833 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  35.62 
 
 		 824 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2918  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.8 
 
 		 740 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777239  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  34.25 
 
 		 806 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  34.25 
 
 		 808 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  34.25 
 
 		 812 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  34.25 
 
 		 804 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  34.25 
 
 		 810 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 802 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  34.25 
 
 		 792 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.8 
 
 		 716 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1112  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.8 
 
 		 716 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  34.25 
 
 		 808 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  34.25 
 
 		 806 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  34.25 
 
 		 808 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  31.87 
 
 		 778 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  34.25 
 
 		 806 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  33.7 
 
 		 818 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  34.25 
 
 		 813 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0462  RNA binding S1 domain protein  35.78 
 
 		 769 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  26.4 
 
 		 817 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  34.25 
 
 		 813 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  33.98 
 
 		 787 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  32 
 
 		 598 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  34.25 
 
 		 813 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  34.25 
 
 		 813 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>