More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2267 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  866    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 418 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 377 aa  193  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  29.33 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  30.73 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 410 aa  176  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 426 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  28.47 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 424 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>