220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0572 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 353 aa  727    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  64.1 
 
 		 350 aa  502  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  58.71 
 
 		 356 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  47.62 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  48.19 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  44.53 
 
 		 270 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  33.78 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  31.54 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  27.51 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.09 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.3 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.71 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.95 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.56 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 532 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 489 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 800 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 481 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  21.54 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 476 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 430 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  28.75 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 452 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  21.69 
 
 		 489 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 427 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.73 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 480 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.17 
 
 		 445 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 536 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>