More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0457 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  760    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  57.07 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  29.69 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.38 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  29.47 
 
 		 500 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.31 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.31 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.31 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.31 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 446 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  28.36 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  30.17 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  29.49 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 439 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  29.69 
 
 		 552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  27.44 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  27.08 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  28.73 
 
 		 503 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 462 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  27.62 
 
 		 500 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 444 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  28.4 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  28.4 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.55 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  30.61 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  28.26 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  29.35 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.55 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  30.79 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  29.33 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  29.33 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  25.74 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.61 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.21 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  28.87 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  28.5 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>