More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3469 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  931    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  98.49 
 
 		 466 aa  889    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  99.35 
 
 		 462 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  82.9 
 
 		 435 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  75.89 
 
 		 437 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  77.99 
 
 		 433 aa  641    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  75.06 
 
 		 445 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 		 445 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  73.81 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  68.02 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  68.51 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  68.51 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  69.25 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  66.05 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  69.25 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  63.68 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  66.5 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  63.9 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  66.42 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  65 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  63.18 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  64.73 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  64.73 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  64.73 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  64.73 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  64.73 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  64.49 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  62.29 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  64.29 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  64.04 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  62 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  62 
 
 		 436 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  63.55 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  57.97 
 
 		 435 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  63.55 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  63.79 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  59.76 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  58.1 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  59.16 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  60.38 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  55.16 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  57.52 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  53.54 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  51.22 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  50 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  50 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  43.75 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  47.15 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 441 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.89 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 		 436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  45.16 
 
 		 432 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  45.34 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  43.83 
 
 		 431 aa  333  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  40.29 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  37.03 
 
 		 415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  36.41 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.96 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 433 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 457 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  31.8 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 444 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  32.54 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  36.52 
 
 		 431 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.6 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  32.6 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  32.4 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.36 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  33.49 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  33.49 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  33.49 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  33.49 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  32.65 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  32.79 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>