230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6262 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  67.26 
 
 		 239 aa  304  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  55.7 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  50 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  46.73 
 
 		 1061 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  47.15 
 
 		 1063 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  39.69 
 
 		 692 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.22 
 
 		 1190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 1111 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 346 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 713 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 344 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  38.38 
 
 		 1096 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 346 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 792 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 372 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 662 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 1096 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 583 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 384 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.49 
 
 		 844 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.39 
 
 		 842 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 601 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 484 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.55 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 1124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  35.68 
 
 		 856 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 500 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 867 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.67 
 
 		 500 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 571 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 586 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 759 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 575 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.22 
 
 		 849 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 352 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 725 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 713 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.63 
 
 		 717 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 336 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  32.14 
 
 		 930 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 387 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 488 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 499 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 930 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 934 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  36.22 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  31.89 
 
 		 478 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 1132 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 717 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 1132 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 336 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 488 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 488 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 489 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  31.98 
 
 		 993 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 929 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 1202 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 503 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 602 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  31.19 
 
 		 1003 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 488 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 1039 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  34.41 
 
 		 352 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 655 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 850 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 1191 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 856 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.12 
 
 		 852 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 855 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  33 
 
 		 655 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 635 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 489 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 631 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 840 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 561 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 572 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 409 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 738 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 728 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 364 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.89 
 
 		 728 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 907 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 555 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 620 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 588 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  30.81 
 
 		 480 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 577 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 512 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 356 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 550 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>