More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4082 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.34 
 
 		 454 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 457 aa  913    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.66 
 
 		 454 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  65.57 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.24 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  44.12 
 
 		 399 aa  282  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  37.67 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  38.63 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  38.54 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  36.5 
 
 		 422 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  39 
 
 		 489 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  39 
 
 		 489 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  36.02 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  39.3 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  38.72 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  38.44 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  37.09 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  37.09 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  38.06 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  38.61 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  39.17 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  35.68 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  35.68 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  35.68 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  35.68 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 459 aa  220  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  36.6 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  38.98 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  33.56 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  37.43 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.74 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.57 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  37.15 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  37.15 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  37.15 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  37.15 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  35.45 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  37.15 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  36.87 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  35.4 
 
 		 503 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  36.41 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 401 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  36.14 
 
 		 484 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  34.39 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  36.44 
 
 		 491 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.97 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  32.98 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.06 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.59 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  35.46 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  30.58 
 
 		 423 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  33.07 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  33.87 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  32.25 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  31.33 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  40.7 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  38.19 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  40.5 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 330 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.69 
 
 		 331 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  40.2 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 		 329 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  37.19 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  38.38 
 
 		 330 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  29.81 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  36.18 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  36.68 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 390 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 390 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  32.09 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  30.31 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  34.17 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  31.52 
 
 		 344 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0386  hypothetical protein  36.14 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>