110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1625 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  100 
 
 		 438 aa  857    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  57.93 
 
 		 437 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  49.64 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  50.95 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  46.8 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  46.25 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  45.52 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  45.62 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  45.62 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  45.28 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  44.53 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  36.5 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  34.96 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  34.7 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  36.04 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.42 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  35.29 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  33.75 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  34.26 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  34.26 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  34.26 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  34.09 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  36.06 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  35.7 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  37.91 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  37.91 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  36.87 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  33.26 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  30.66 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  34.86 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  31.75 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 419 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.78 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  31.44 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  29.97 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  30.93 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  28.11 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.2 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  25.92 
 
 		 444 aa  113  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.68 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  25.27 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  30.85 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  30.85 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.29 
 
 		 454 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  21.85 
 
 		 496 aa  90.1  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  24.05 
 
 		 437 aa  87  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  31.49 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.61 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.52 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.88 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  28.79 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  28.79 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  30.91 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3383  hypothetical protein  26.76 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.34 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.15 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.73 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.26 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.21 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.69 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>