25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3383 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3383  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  819    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  28 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  26.78 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  28.81 
 
 
437 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  23.87 
 
 
473 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  23.35 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.52 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  23.22 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 
433 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.56 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  17.58 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.71 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  22.91 
 
 
463 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  30.68 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>