57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0736 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  68.9 
 
 
294 aa  417  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  79.73 
 
 
586 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  74.78 
 
 
877 aa  342  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  40 
 
 
627 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1027  argininosuccinate synthase  37.97 
 
 
280 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0529308  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1029  hypothetical protein  36 
 
 
254 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.785659  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2188  hypothetical protein  36.41 
 
 
1103 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1717  amino acid carrier protein  32.74 
 
 
2772 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.954872  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  59.57 
 
 
579 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  57.78 
 
 
919 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  69.44 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1718  hypothetical protein  29.96 
 
 
965 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  62.16 
 
 
739 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  42.34 
 
 
787 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  51 
 
 
848 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  70.15 
 
 
930 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  67.14 
 
 
668 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  68.66 
 
 
627 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  61.45 
 
 
676 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  65.71 
 
 
387 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  64.29 
 
 
735 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  54.88 
 
 
581 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  70.15 
 
 
522 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  61.54 
 
 
709 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  53.76 
 
 
831 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  65.22 
 
 
958 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  39.42 
 
 
361 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  59.46 
 
 
869 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  64.29 
 
 
749 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  53.57 
 
 
403 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  60.76 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  51.61 
 
 
479 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  66.67 
 
 
561 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  56.98 
 
 
390 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  58.67 
 
 
433 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  65.67 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  60.29 
 
 
522 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  56.34 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  57.53 
 
 
468 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  57.14 
 
 
697 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.78 
 
 
547 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  51.95 
 
 
698 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  48.1 
 
 
1056 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  47.13 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  48.53 
 
 
884 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  48.57 
 
 
883 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  40 
 
 
528 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  52.54 
 
 
595 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  45.59 
 
 
887 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
594 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  43.1 
 
 
472 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  36.62 
 
 
975 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  26.59 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.66 
 
 
1531 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  42.86 
 
 
720 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>