19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2188 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 1103 aa  2248    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1717  amino acid carrier protein  36.76 
 
 		 2772 aa  439  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.954872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0179  hypothetical protein  33.54 
 
 		 544 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  41.92 
 
 		 627 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  37.13 
 
 		 877 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  39.5 
 
 		 294 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1027  argininosuccinate synthase  39.21 
 
 		 280 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0529308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  38.94 
 
 		 586 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1029  hypothetical protein  39.9 
 
 		 254 aa  125  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.785659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  36.41 
 
 		 298 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1718  hypothetical protein  33.06 
 
 		 965 aa  103  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1052 aa  62.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  27.75 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1030 aa  55.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  29.75 
 
 		 778 aa  51.6  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1548  hypothetical protein  32 
 
 		 534 aa  48.9  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1577  hypothetical protein  28.95 
 
 		 374 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.806322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35 
 
 		 726 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1351 aa  44.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>