83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0739 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  100 
 
 
877 aa  1767    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  78.39 
 
 
586 aa  624  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0179  hypothetical protein  47.82 
 
 
544 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  72.15 
 
 
298 aa  342  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  57.97 
 
 
294 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  43.05 
 
 
627 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1029  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  163  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.785659  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1027  argininosuccinate synthase  38.4 
 
 
280 aa  153  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0529308  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2188  hypothetical protein  40.28 
 
 
1103 aa  140  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1717  amino acid carrier protein  38.12 
 
 
2772 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.954872  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1718  hypothetical protein  36.64 
 
 
965 aa  125  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  63.86 
 
 
401 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  60.24 
 
 
954 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  72.86 
 
 
966 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  54.76 
 
 
627 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.8 
 
 
930 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  54.65 
 
 
1380 aa  96.3  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  58.75 
 
 
2554 aa  95.9  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  58.75 
 
 
1732 aa  95.9  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  57.5 
 
 
1356 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  58.54 
 
 
719 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.5 
 
 
3295 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  57.69 
 
 
802 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 
870 aa  88.2  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  56.25 
 
 
823 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  52.5 
 
 
840 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  56.76 
 
 
845 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 
910 aa  71.2  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1548  hypothetical protein  24.62 
 
 
534 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1447  PT repeat-containing protein  31.21 
 
 
618 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.71 
 
 
978 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.14 
 
 
1969 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  31.55 
 
 
1682 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  38.18 
 
 
940 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1577  hypothetical protein  21.68 
 
 
374 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.806322  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.64 
 
 
528 aa  56.6  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  30.96 
 
 
658 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.63 
 
 
713 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  39.53 
 
 
1830 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  22.69 
 
 
861 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.04 
 
 
816 aa  52  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.12 
 
 
679 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  29.3 
 
 
859 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  41.89 
 
 
735 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.41 
 
 
675 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.16 
 
 
1282 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
930 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  31.15 
 
 
400 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.2 
 
 
685 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.11 
 
 
2000 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  29.69 
 
 
917 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29 
 
 
963 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.78 
 
 
1094 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.77 
 
 
752 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  28.88 
 
 
684 aa  48.9  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  33.51 
 
 
1328 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.67 
 
 
669 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  37.63 
 
 
460 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.09 
 
 
1783 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.51 
 
 
2122 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  29.44 
 
 
575 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.19 
 
 
1862 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.38 
 
 
1300 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  39.76 
 
 
787 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30 
 
 
615 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  28.25 
 
 
1292 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  28.49 
 
 
408 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  32.89 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
530 aa  47  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  32.46 
 
 
778 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  34.44 
 
 
587 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  29.26 
 
 
439 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.18 
 
 
519 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.92 
 
 
2036 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.92 
 
 
2272 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  28.25 
 
 
791 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  27.18 
 
 
958 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.74 
 
 
581 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.87 
 
 
644 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
1361 aa  44.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  28.86 
 
 
996 aa  44.3  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.53 
 
 
1602 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  41.3 
 
 
815 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>