82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1608 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  64.56 
 
 		 1047 aa  1211    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  64.78 
 
 		 1045 aa  1224    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  84.74 
 
 		 1040 aa  1575    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  44.28 
 
 		 1043 aa  675    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  64.66 
 
 		 1047 aa  1214    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1037 aa  1981    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  66.06 
 
 		 1054 aa  1217    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1049 aa  634  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  41.48 
 
 		 1076 aa  631  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  42.03 
 
 		 1049 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  42.09 
 
 		 1048 aa  625  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  42.63 
 
 		 1053 aa  619  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  42.43 
 
 		 1048 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  41.97 
 
 		 1049 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  41.62 
 
 		 1042 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  44.61 
 
 		 1015 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  40.57 
 
 		 1052 aa  588  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  41 
 
 		 1042 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  39.96 
 
 		 1052 aa  561  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1052 aa  562  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  36.14 
 
 		 1047 aa  551  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  38.25 
 
 		 1064 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  39.31 
 
 		 1064 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  39.05 
 
 		 1001 aa  532  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  38 
 
 		 1059 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  37.76 
 
 		 1062 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  40.9 
 
 		 1018 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  36.64 
 
 		 999 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1016 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  35.02 
 
 		 977 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  35.5 
 
 		 991 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  36.24 
 
 		 1014 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  35.67 
 
 		 997 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  35.57 
 
 		 997 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.64 
 
 		 986 aa  338  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33.62 
 
 		 988 aa  337  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.85 
 
 		 993 aa  321  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.62 
 
 		 980 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.8 
 
 		 991 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  34.33 
 
 		 959 aa  284  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  38.46 
 
 		 1000 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.54 
 
 		 911 aa  184  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.48 
 
 		 914 aa  168  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  20.21 
 
 		 890 aa  159  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.88 
 
 		 958 aa  101  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.74 
 
 		 962 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  27.07 
 
 		 947 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.02 
 
 		 976 aa  88.6  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.07 
 
 		 957 aa  85.5  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  25.68 
 
 		 779 aa  82  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  21.84 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  21.55 
 
 		 788 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.55 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.43 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.92 
 
 		 908 aa  72  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.67 
 
 		 836 aa  67.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.89 
 
 		 911 aa  65.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  25 
 
 		 994 aa  64.3  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  23.53 
 
 		 858 aa  61.6  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.5 
 
 		 915 aa  61.2  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  22.33 
 
 		 858 aa  59.3  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.59 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.44 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.56 
 
 		 855 aa  55.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  19.67 
 
 		 794 aa  55.5  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.09 
 
 		 781 aa  55.1  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.69 
 
 		 935 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.69 
 
 		 846 aa  54.3  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  29.1 
 
 		 984 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  24.38 
 
 		 1124 aa  52.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  21.2 
 
 		 991 aa  52.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  24.77 
 
 		 864 aa  51.6  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.19 
 
 		 919 aa  51.6  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.83 
 
 		 856 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.99 
 
 		 997 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  31.45 
 
 		 896 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.51 
 
 		 781 aa  49.7  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  35.19 
 
 		 1055 aa  47.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 1134 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.57 
 
 		 1049 aa  44.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 1050 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>