244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4291 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  35.66 
 
 
248 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  37.63 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  35.1 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  39.68 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  38.62 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  39.68 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  39.15 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  37.88 
 
 
249 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  39.06 
 
 
249 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  36.41 
 
 
248 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  36.79 
 
 
251 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.63 
 
 
249 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  34.82 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  31.82 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.07 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  33.77 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.67 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  30.28 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.77 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.54 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.8 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.06 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.56 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  27.41 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  26.74 
 
 
295 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.06 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.06 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.06 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  29.96 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  29.37 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  36.48 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.87 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  30.04 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  27.14 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  34.36 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  27.23 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.05 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.57 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  32.02 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  27.47 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  25.77 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.52 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  27.92 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  31.45 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.09 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.57 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  28.63 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  27.82 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.85 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  27.82 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  26.69 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  27.44 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  27.56 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.38 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  31.68 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  31.52 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  34.51 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  28.89 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  26.61 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.89 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  27.63 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  30.12 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.08 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  25.1 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  23.81 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  26.85 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.36 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  30.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.02 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  25.78 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  33.59 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  32.91 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  26.98 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  30.42 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  26.15 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  28.31 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.54 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  30.35 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.75 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  30.34 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  28.31 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  26.99 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  28.44 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  26.9 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  25.1 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  35.59 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  24.03 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  26.64 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.52 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  28.09 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  37.4 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>