More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0462 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  50.75 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  41.09 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.62 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  26.52 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  28.86 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.23 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.68 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.02 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.09 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.78 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.88 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.6 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.23 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.82 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.31 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  36.9 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  22.38 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  24.24 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.95 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>