278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0455 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  842    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  60.78 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  58.08 
 
 
408 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  50.13 
 
 
418 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  48.48 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.68 
 
 
420 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.74 
 
 
424 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  47.15 
 
 
411 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  46.73 
 
 
427 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  46.48 
 
 
427 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  48.21 
 
 
417 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  46.48 
 
 
427 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  48.1 
 
 
416 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  47.85 
 
 
416 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  43.25 
 
 
415 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.96 
 
 
424 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  44.72 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 
433 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.95 
 
 
417 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  41.52 
 
 
415 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.39 
 
 
407 aa  318  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  45.5 
 
 
418 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  41.75 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.25 
 
 
416 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  44.36 
 
 
429 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.73 
 
 
591 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  41.15 
 
 
426 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.36 
 
 
593 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40 
 
 
409 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.76 
 
 
409 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 
409 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.68 
 
 
591 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.47 
 
 
589 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.32 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.68 
 
 
592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 
599 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.21 
 
 
589 aa  282  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  39.79 
 
 
425 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.53 
 
 
592 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.25 
 
 
599 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 
594 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  38.82 
 
 
419 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 
406 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.53 
 
 
592 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.87 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.02 
 
 
411 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 
429 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.03 
 
 
430 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.88 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  35.05 
 
 
428 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 
422 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.84 
 
 
412 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.62 
 
 
412 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 
416 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 
415 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.09 
 
 
410 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  35 
 
 
423 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 
427 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 
426 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.98 
 
 
428 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.01 
 
 
413 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.56 
 
 
418 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 
430 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 
412 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.94 
 
 
422 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  34.17 
 
 
423 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.15 
 
 
413 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 
416 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 
426 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 
425 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 
425 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 
425 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  34.44 
 
 
423 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  34.45 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 
418 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.61 
 
 
415 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
431 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.68 
 
 
423 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.51 
 
 
407 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 
429 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
422 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
427 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  33.67 
 
 
442 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 
420 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  32.04 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  35.68 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.99 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.49 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 
421 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.19 
 
 
399 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
426 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
426 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  32.19 
 
 
427 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 
427 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33 
 
 
420 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>