275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5774 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
399 aa  793    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  65.41 
 
 
417 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  61.39 
 
 
435 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  61.52 
 
 
404 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  62.28 
 
 
404 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  57.87 
 
 
387 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  56.53 
 
 
407 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  57.5 
 
 
438 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  57.89 
 
 
394 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  60 
 
 
391 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  52.42 
 
 
428 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  55.75 
 
 
407 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  52.26 
 
 
416 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  47.16 
 
 
393 aa  308  8e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 
409 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
408 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  32.62 
 
 
425 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.6 
 
 
412 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.58 
 
 
409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.49 
 
 
447 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 
411 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 
411 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 
411 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 
411 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.27 
 
 
424 aa  187  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.32 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  31.82 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.07 
 
 
411 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  31.82 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  36.01 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  31.82 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30.1 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.1 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 
422 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  31.57 
 
 
411 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
415 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.63 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.22 
 
 
417 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
416 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  31.82 
 
 
411 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.21 
 
 
416 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  35.91 
 
 
411 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  36.27 
 
 
417 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 
414 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.92 
 
 
419 aa  176  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  38.73 
 
 
418 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.47 
 
 
479 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
430 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.76 
 
 
407 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.02 
 
 
416 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.43 
 
 
415 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 
415 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  34.26 
 
 
429 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 
471 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.68 
 
 
431 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 
433 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 
425 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  33.9 
 
 
422 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.18 
 
 
422 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.18 
 
 
420 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.18 
 
 
420 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.26 
 
 
523 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.49 
 
 
518 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  34.18 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.01 
 
 
418 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 
429 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 
407 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 
407 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 
459 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 
459 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  31.08 
 
 
413 aa  166  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5813  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734094  normal  0.203308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.75 
 
 
424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  35.56 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.04 
 
 
427 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 
407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.07 
 
 
412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  33.42 
 
 
442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.1 
 
 
431 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 
417 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  33.69 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
407 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 
427 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  31.77 
 
 
418 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28429  beta alanine synthase  28.94 
 
 
432 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 
415 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.93 
 
 
418 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.82 
 
 
415 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
459 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
459 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
459 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
459 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>