274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1109 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 404 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  92.08 
 
 		 404 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  62.28 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  57 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  58.94 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.87 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  56.35 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  54.25 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  53.76 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  52.76 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  57.82 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  52.41 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  52.3 
 
 		 407 aa  332  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  46.06 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.01 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.94 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.86 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.54 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  31.63 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  31.63 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  31.63 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  31.38 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  30.48 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  30.51 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.4 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.89 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.04 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.5 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0582  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.31 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.8 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.9 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.64 
 
 		 518 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.24 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.24 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.48 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.67 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  34.82 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  32.82 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  32.17 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.25 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  32.11 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  34.33 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.28 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.65 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.46 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29.3 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  30.63 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.52 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  29.8 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  36.18 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.93 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.25 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  31.99 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.83 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  37.82 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.85 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.67 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  33.7 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.82 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.94 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.06 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.99 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.56 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.93 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  32.66 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  30.94 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.29 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  32.98 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  33.08 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>