273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2999 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 		 435 aa  844    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  61.75 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  60.6 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  61.39 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  57.75 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  56.87 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.39 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  62.2 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  55.42 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  52.24 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  53.83 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  51.71 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  53.98 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  44.64 
 
 		 393 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.56 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.18 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.57 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.96 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.34 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.31 
 
 		 447 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.84 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.5 
 
 		 415 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  32.09 
 
 		 411 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  32.09 
 
 		 411 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  32.09 
 
 		 411 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.13 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.7 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  29.82 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  31.09 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.18 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  31.51 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  31.09 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  31.09 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  31.09 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  31.09 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.42 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  32.89 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.5 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.77 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 		 429 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29.35 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.21 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.79 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.6 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.79 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.6 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  34.4 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  34.76 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  34.06 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.76 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.99 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28429  beta alanine synthase  26.87 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.91 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.16 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  31.4 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  30.41 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  31.08 
 
 		 502 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.1 
 
 		 431 aa  156  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  33.67 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  35.07 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.83 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  34.51 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 		 421 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 		 422 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.16 
 
 		 424 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  31.46 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.14 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  32.54 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  31.89 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  32.21 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  30.66 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.59 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>