273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1154 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  100 
 
 
399 aa  825    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 
411 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 
411 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  36.14 
 
 
411 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
411 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  36.14 
 
 
411 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  36.21 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 
413 aa  217  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  32.66 
 
 
429 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  33.92 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
415 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 
412 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  32.49 
 
 
409 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.91 
 
 
415 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.25 
 
 
426 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  33.75 
 
 
408 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.76 
 
 
413 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 
409 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.59 
 
 
424 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 
437 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 
414 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.41 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.91 
 
 
409 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
427 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  32.59 
 
 
414 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.91 
 
 
428 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.51 
 
 
426 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.41 
 
 
421 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.09 
 
 
412 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  31.69 
 
 
408 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
426 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 
415 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 
407 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.69 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 
423 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  32.13 
 
 
425 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  31.55 
 
 
417 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  31.91 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.58 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  32.49 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 
411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  31.59 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 
425 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  32.65 
 
 
422 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 
425 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
412 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  31.66 
 
 
418 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 
425 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.59 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 
423 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  32.05 
 
 
442 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  31.51 
 
 
427 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
425 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  32.46 
 
 
479 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.95 
 
 
415 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  31.41 
 
 
418 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  31.41 
 
 
418 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 
425 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  31.85 
 
 
427 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
426 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  30.5 
 
 
411 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  31.57 
 
 
429 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  32.54 
 
 
426 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.5 
 
 
430 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  32.54 
 
 
426 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  27.71 
 
 
407 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  31.62 
 
 
427 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  31.62 
 
 
427 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  30.96 
 
 
411 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  31.28 
 
 
418 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  32.08 
 
 
427 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 
407 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 
407 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.54 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.66 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  30.64 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  32.01 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  32.54 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.66 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  29.9 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.81 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  31.41 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.2 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  31.12 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  31.12 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  31.73 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  31.12 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  31.12 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>