273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3520 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  66.5 
 
 
407 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  58.42 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  55.05 
 
 
416 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  52.42 
 
 
399 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  52.24 
 
 
435 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  50.24 
 
 
417 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 
407 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.31 
 
 
438 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  52.76 
 
 
404 aa  349  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  52.49 
 
 
404 aa  348  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  48.6 
 
 
387 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  48.86 
 
 
394 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  44.73 
 
 
393 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.49 
 
 
409 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.66 
 
 
430 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.92 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.41 
 
 
409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  31.31 
 
 
411 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  31.06 
 
 
411 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  31.06 
 
 
411 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  31.06 
 
 
411 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  30.81 
 
 
411 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.16 
 
 
419 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  37.76 
 
 
424 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  30.83 
 
 
411 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  39.08 
 
 
415 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.25 
 
 
407 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.43 
 
 
408 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.45 
 
 
411 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.39 
 
 
469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.08 
 
 
427 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.08 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  38.39 
 
 
418 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.95 
 
 
399 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 
415 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29.41 
 
 
413 aa  169  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  32.26 
 
 
411 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.56 
 
 
410 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.71 
 
 
416 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 
429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 
413 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  31.93 
 
 
425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 
417 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.31 
 
 
424 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.03 
 
 
412 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  32.59 
 
 
415 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 
412 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.54 
 
 
420 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 
427 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  34.31 
 
 
421 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  31.09 
 
 
424 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.64 
 
 
421 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  31.31 
 
 
411 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  35.09 
 
 
419 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  34.12 
 
 
431 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  36.02 
 
 
427 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.96 
 
 
427 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 
421 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 
415 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.13 
 
 
415 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  31.52 
 
 
415 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  32.36 
 
 
406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28429  beta alanine synthase  29.07 
 
 
432 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 
414 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  32.73 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 
518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  33.76 
 
 
429 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.76 
 
 
523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.49 
 
 
401 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  31.37 
 
 
408 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  31.62 
 
 
425 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  35.03 
 
 
416 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  31.43 
 
 
411 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.49 
 
 
426 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.75 
 
 
428 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0582  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.17 
 
 
405 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.17 
 
 
430 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  33.76 
 
 
429 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  29.24 
 
 
502 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
430 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  31.75 
 
 
429 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.49 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.91 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  31.15 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  32.33 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  31.41 
 
 
437 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>