273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3617 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
438 aa  852    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  57.5 
 
 
399 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  53.3 
 
 
417 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.39 
 
 
435 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  52.95 
 
 
407 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  52.5 
 
 
387 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  54.21 
 
 
404 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  53.76 
 
 
404 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  51.82 
 
 
394 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  48.76 
 
 
428 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  50.9 
 
 
416 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  54.52 
 
 
391 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  50 
 
 
407 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  43.32 
 
 
393 aa  266  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  32.44 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  32.96 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.88 
 
 
430 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.06 
 
 
409 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  33.11 
 
 
425 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.64 
 
 
411 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  32.64 
 
 
411 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.41 
 
 
411 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.64 
 
 
411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.64 
 
 
411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.48 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.17 
 
 
407 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  31.79 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.93 
 
 
412 aa  179  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34 
 
 
424 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 
411 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 
411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 
411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 
411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  32.87 
 
 
418 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  30.95 
 
 
502 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.56 
 
 
415 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  30.87 
 
 
412 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  31.6 
 
 
408 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  32 
 
 
427 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.49 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.76 
 
 
427 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  28.85 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.53 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  32.64 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.82 
 
 
433 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 
431 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
419 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  26.67 
 
 
411 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  32.19 
 
 
415 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  31.47 
 
 
414 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.07 
 
 
415 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  30.54 
 
 
411 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  30.05 
 
 
429 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
414 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.7 
 
 
447 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  32.81 
 
 
413 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  31.96 
 
 
427 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  33.18 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.17 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.69 
 
 
591 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.43 
 
 
415 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.66 
 
 
421 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.59 
 
 
424 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  30.59 
 
 
427 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  30.32 
 
 
417 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.75 
 
 
407 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  31.22 
 
 
406 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  32.63 
 
 
416 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.62 
 
 
427 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  30.75 
 
 
416 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.25 
 
 
469 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  32.65 
 
 
430 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.56 
 
 
425 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.56 
 
 
425 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  31.28 
 
 
427 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  29.4 
 
 
422 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  31.28 
 
 
427 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  32.95 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  32.5 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  31.63 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  31.76 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  33.79 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 
589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  29.46 
 
 
411 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.21 
 
 
399 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  31.72 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  29.93 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  32.43 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  34.89 
 
 
431 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.42 
 
 
420 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.42 
 
 
420 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  31.53 
 
 
427 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  32.73 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.49 
 
 
419 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.11 
 
 
423 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 
599 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 
589 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.99 
 
 
420 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0221  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.94 
 
 
417 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>