281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4127 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 407 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  66.5 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  66.58 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  57.95 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  54.96 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  55.75 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  53.88 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  53.98 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  52.51 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  51.25 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.55 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  52.55 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  51.53 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  47.91 
 
 		 393 aa  282  9e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 		 409 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.78 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.17 
 
 		 407 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.92 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  34.86 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.82 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.79 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.41 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.31 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.29 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  40.91 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.38 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  37 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.51 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  36.98 
 
 		 429 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.14 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.53 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.14 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.65 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  30 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  33.7 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  30.26 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  30 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  29.74 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.42 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  30 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29 
 
 		 413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  29.23 
 
 		 411 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.82 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.03 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.01 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  31.22 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.51 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  29.97 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.64 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.81 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  29.97 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  33.65 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  29.97 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  29.97 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.88 
 
 		 424 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.76 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.07 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.67 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.41 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.44 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  33.96 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.16 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.5 
 
 		 591 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.57 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.06 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33.16 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.62 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  34.28 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.64 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.92 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  35 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.74 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  32.56 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.28 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 		 412 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  33.14 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  32.39 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.09 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>