273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1779 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  59.9 
 
 		 417 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  57.87 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  57.75 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  56 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  56.35 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  52.5 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  55.58 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  52.64 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  53.63 
 
 		 407 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  56.65 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  51.77 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  48.6 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  48.79 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.24 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.9 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.04 
 
 		 469 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 430 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.73 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.99 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.9 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  32.22 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.57 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  32.23 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.93 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.64 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.5 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  32.82 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  30.36 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 427 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  35 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.73 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  36.88 
 
 		 414 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.45 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  31.22 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.19 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.01 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.58 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.03 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  30.05 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.05 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  35 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1881  amidase hydantoinase/carbamoylase family  31.23 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  36.2 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.77 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  32.73 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.01 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  32.91 
 
 		 426 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.74 
 
 		 447 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.84 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1867  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.77 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.03 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.74 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  32.18 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  33.6 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.57 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  29.58 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.27 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.27 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  34.5 
 
 		 408 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.59 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  31.67 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.43 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.56 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.07 
 
 		 518 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.08 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.08 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>