274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1422 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 416 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  62.99 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  57.95 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  55.05 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  51.11 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.95 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  53.02 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  52.72 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  51 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  52.76 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  53.03 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  50.9 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  51 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  47.51 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  31.27 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.06 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.82 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.82 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.82 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.05 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  32.17 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.39 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.01 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.26 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  34.86 
 
 		 417 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  31.75 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  33.97 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.66 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.91 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.54 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.62 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.5 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.82 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  31.75 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.5 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.76 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.8 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.11 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.83 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  31.57 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.74 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.17 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.88 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  35.29 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.76 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  33.51 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  34.64 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28429  beta alanine synthase  28.87 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.57 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  33.92 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0582  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.09 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  32.58 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.79 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.82 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.7 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.07 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.25 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  31.97 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.57 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  32.51 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.86 
 
 		 518 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  32.34 
 
 		 427 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  32.59 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  34.4 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.32 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  31.67 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  33.58 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>