274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4387 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4387  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  57.89 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  58.69 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  58.94 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  55.11 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1779  allantoate amidohydrolase  52.64 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2999  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  53.83 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3617  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.82 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1422  allantoate amidohydrolase  50.5 
 
 		 416 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  48.86 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4127  allantoate amidohydrolase  51.25 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6264  allantoate amidohydrolase  53.7 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  42.42 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.99 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.82 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.03 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.05 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  32.32 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.31 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.31 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.05 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.06 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.57 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 422 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.03 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 423 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  30.2 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.24 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  28.57 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.68 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  33.94 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 		 433 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.02 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  33.52 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.32 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.6 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.13 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  34.35 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  33.78 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  31.62 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.59 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.66 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  31.68 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  30.64 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.75 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  32.26 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.09 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.09 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28429  beta alanine synthase  26.2 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.99 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29.81 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  30.89 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  33.79 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  30.05 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  32.27 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  31.98 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  32.1 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.03 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.75 
 
 		 421 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  31.9 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.59 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.63 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.57 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.63 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  30.39 
 
 		 431 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.57 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.87 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  30.48 
 
 		 411 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  31.25 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  32.64 
 
 		 423 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 471 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  32.34 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  29.54 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  33.18 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  31.7 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  32.16 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>