176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3592 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1126    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  50.7 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  35 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 241 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.5 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  30.47 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  42.25 
 
 		 347 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  42.25 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  41.1 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.28 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  35.53 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  36.52 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  35.53 
 
 		 308 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  33.9 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 352 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  34.17 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  34.21 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  40.85 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  35.59 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  41.43 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.62 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  42.03 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  41.18 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  35.14 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  35 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.59 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  36.11 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  35.21 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.56 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  35.71 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  42.62 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  36.78 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  39.39 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  36.11 
 
 		 368 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  36.79 
 
 		 368 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 334 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  28.06 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.59 
 
 		 491 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  33.7 
 
 		 281 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  41.18 
 
 		 334 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  34.02 
 
 		 311 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  41.18 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.49 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  38.03 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  44.12 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 370 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 267 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 338 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 296 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  33.58 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 339 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 362 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  28.57 
 
 		 340 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 339 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  29.03 
 
 		 251 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  34.88 
 
 		 142 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  28.86 
 
 		 376 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  37.18 
 
 		 362 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  37.18 
 
 		 360 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  37.18 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  37.18 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  37.18 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  37.68 
 
 		 280 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 351 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  25.6 
 
 		 372 aa  53.5  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 328 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  39.34 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  35.29 
 
 		 511 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  38.36 
 
 		 340 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>