More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1291 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  55.35 
 
 
326 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  54.43 
 
 
322 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  54.8 
 
 
332 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  54.37 
 
 
328 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  54.63 
 
 
328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  53.68 
 
 
327 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  51.37 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  52.91 
 
 
329 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  52.91 
 
 
329 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  54.46 
 
 
336 aa  349  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  51.53 
 
 
328 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  49.24 
 
 
335 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  48.96 
 
 
335 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
328 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  49.54 
 
 
330 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  47.08 
 
 
336 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  47.38 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  46.04 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  44.17 
 
 
327 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  44.17 
 
 
327 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 
336 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  45.87 
 
 
336 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  43.6 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  41.28 
 
 
327 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  41.28 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  36.17 
 
 
332 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.09 
 
 
348 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.24 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.86 
 
 
391 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  45.11 
 
 
366 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 
324 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.11 
 
 
335 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.72 
 
 
322 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
322 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  32.95 
 
 
360 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  36.15 
 
 
335 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.35 
 
 
308 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  31.39 
 
 
338 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.03 
 
 
320 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  34.15 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.46 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  39.41 
 
 
369 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.92 
 
 
369 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  31.37 
 
 
332 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
332 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  34.45 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.81 
 
 
323 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  35.15 
 
 
425 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 
323 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  34.16 
 
 
388 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  27.8 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.11 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  31.28 
 
 
325 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.2 
 
 
468 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  30.67 
 
 
367 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.42 
 
 
477 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.51 
 
 
493 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 
459 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.33 
 
 
426 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.25 
 
 
451 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.56 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  34.7 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  34.74 
 
 
405 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  31.67 
 
 
401 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.08 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.09 
 
 
430 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.5 
 
 
419 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.98 
 
 
425 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.74 
 
 
388 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  32.82 
 
 
641 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  29.96 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 
659 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  31.97 
 
 
414 aa  108  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
317 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.02 
 
 
614 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  30.62 
 
 
412 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  32.27 
 
 
659 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  29.44 
 
 
408 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.23 
 
 
379 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  29.66 
 
 
436 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.18 
 
 
640 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  30.08 
 
 
393 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  28.34 
 
 
407 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  30.23 
 
 
804 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.62 
 
 
635 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  30.49 
 
 
499 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  32.74 
 
 
641 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.17 
 
 
636 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.74 
 
 
639 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  32.74 
 
 
639 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.89 
 
 
604 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.49 
 
 
608 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30.9 
 
 
810 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  29.41 
 
 
667 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  29.96 
 
 
641 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>