More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0614 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  100 
 
 		 310 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  46.82 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  28.96 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  32.83 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  35.25 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  29.29 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  27.97 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  28.47 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  29.47 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  30.18 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  30.32 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  32.25 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  30.96 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  29.93 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  33.47 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  33.2 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  30.53 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.82 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  28.21 
 
 		 592 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  31.72 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  28.21 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  32.12 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  30.45 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  30.15 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  30.6 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  32.59 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  32.26 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  33 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  32.41 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  29.25 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  33 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  28.1 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  29.89 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  27.76 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  31.9 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  34.48 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  30.77 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  26.79 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  32.96 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1331  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.4 
 
 		 569 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  31.54 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  31.68 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  34.55 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  27.73 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35.68 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  29.33 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  31.25 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  30.58 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  30.77 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0099  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.9 
 
 		 653 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.74 
 
 		 625 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  29.03 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  29.03 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  29.06 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04150  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25 
 
 		 591 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  30.2 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  31.5 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  28.77 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  30.08 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  30.77 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  31.79 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  30.23 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  30.04 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  28.4 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  27.08 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  28.29 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  30.69 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  29.8 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  27.3 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  32.93 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0983  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.62 
 
 		 624 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  31.37 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0130  Transketolase central region  29.75 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  32.98 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  30.19 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  26.88 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  29.21 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  27.57 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  29 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  28.29 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  29.07 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1900  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  26.34 
 
 		 623 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00488607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  36.36 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  29.81 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  26.41 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1447  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.69 
 
 		 635 aa  89.7  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1378  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.69 
 
 		 635 aa  89.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  29.19 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  30.89 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  27.9 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  27.9 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  27.9 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2403  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.32 
 
 		 626 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  29.73 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  30.96 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1061  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.74 
 
 		 627 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00520521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  28.21 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0527  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.06 
 
 		 631 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  32.76 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  25.7 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>