More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0274 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  93.46 
 
 		 215 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  92.99 
 
 		 216 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  75.83 
 
 		 213 aa  324  8.000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  57.82 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  44.34 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  41.31 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  35 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  34.67 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  34.7 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  36.07 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  33.03 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  35.85 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  33.64 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  35.21 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  33.94 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  30 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.94 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  36.92 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  31.28 
 
 		 333 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 332 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  30.84 
 
 		 330 aa  92  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 330 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  32.6 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  28.32 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  31.6 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  25.88 
 
 		 358 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  27.73 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  28.28 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.15 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  28.07 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  27.43 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  30.61 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.62 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  24.19 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  26.13 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  26.69 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  26.46 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  25.11 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  26.69 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  26.46 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.57 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  25.93 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  23.53 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.36 
 
 		 658 aa  62  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  26.64 
 
 		 407 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  28.19 
 
 		 388 aa  62  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  25.41 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  24.86 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  25 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  26.09 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  26.92 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  26.67 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  25.25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  22.04 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  25.93 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.9 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  25.23 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  22.98 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  26.27 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  25.47 
 
 		 379 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  24.73 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  24.73 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  22.04 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  22.97 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  22.34 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  25.74 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  25.81 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  27.84 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  22.58 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  26.13 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  26.29 
 
 		 554 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  22.87 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  23.66 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.75 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  23.78 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  27.08 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  22.7 
 
 		 358 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  21.63 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  23.61 
 
 		 414 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  21.61 
 
 		 348 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  23.74 
 
 		 358 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  23.77 
 
 		 456 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  26.32 
 
 		 369 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  24.19 
 
 		 352 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  23.87 
 
 		 458 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  21.51 
 
 		 347 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  23.91 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  25.13 
 
 		 327 aa  53.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  23.91 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  26.74 
 
 		 355 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  21.51 
 
 		 347 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  23.19 
 
 		 363 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  21.81 
 
 		 359 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  27.57 
 
 		 357 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  23.78 
 
 		 356 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  21.51 
 
 		 363 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  20.74 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>