123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2285 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
314 aa  630  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  40.92 
 
 
355 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  40.18 
 
 
343 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  40 
 
 
332 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
383 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  40.75 
 
 
324 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
358 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 
351 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
330 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
328 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
367 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  36.31 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 
313 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  36.26 
 
 
843 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
339 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
354 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
341 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
368 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  34.71 
 
 
328 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  34.71 
 
 
328 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  34.39 
 
 
328 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
369 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.38 
 
 
328 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 
360 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  34.48 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
329 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
407 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  34.08 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
323 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  35.16 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
333 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
346 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  31.3 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  32.36 
 
 
349 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
342 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
338 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
342 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  29.18 
 
 
337 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
342 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  30.89 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  30.72 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  32.93 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  30.94 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.39 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.17 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.4 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3831  amine oxidase  31.37 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  27.59 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  26.43 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.18 
 
 
362 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.71 
 
 
413 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  24.4 
 
 
381 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  50.91 
 
 
445 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25.68 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  41.18 
 
 
418 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.91 
 
 
523 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
510 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  30.43 
 
 
436 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  42.11 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  43.86 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  53.66 
 
 
628 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  40.68 
 
 
434 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  48.15 
 
 
415 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  41.67 
 
 
460 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92705  predicted protein  24.33 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844655  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.74 
 
 
451 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
545 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  52.5 
 
 
647 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  52.5 
 
 
647 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.65 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  52.38 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  28.42 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  46.43 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  27.56 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.39 
 
 
914 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  28.92 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  43.4 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  40.74 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  50 
 
 
645 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  52.38 
 
 
469 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  32.97 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  37.65 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  37.65 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  47.73 
 
 
647 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  37.65 
 
 
400 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  37.33 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  41.51 
 
 
426 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>