More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15090 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  45.58 
 
 		 1167 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1176 aa  2286    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  42.92 
 
 		 1128 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  45.95 
 
 		 1183 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  41.62 
 
 		 1192 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.65 
 
 		 1111 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  41.09 
 
 		 1144 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  38.81 
 
 		 1103 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  40.12 
 
 		 1108 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  40.54 
 
 		 1162 aa  602  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  39.55 
 
 		 1128 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  41.18 
 
 		 1136 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  39.16 
 
 		 1128 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  38.43 
 
 		 1041 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  38.69 
 
 		 1164 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  40.83 
 
 		 1120 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 		 1150 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 1119 aa  548  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  37.59 
 
 		 1091 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.29 
 
 		 1090 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 		 1130 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  38.21 
 
 		 1091 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.72 
 
 		 1119 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 1091 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 1091 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.59 
 
 		 1106 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.53 
 
 		 1094 aa  522  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 		 1073 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  36.93 
 
 		 1101 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  38 
 
 		 1111 aa  519  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  37.8 
 
 		 1086 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 		 1088 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.23 
 
 		 1228 aa  446  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  38.07 
 
 		 1349 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  38.48 
 
 		 1124 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.58 
 
 		 1343 aa  247  9e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.75 
 
 		 729 aa  190  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.47 
 
 		 1023 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 1397 aa  186  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.48 
 
 		 763 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 773 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 857 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 781 aa  179  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.73 
 
 		 829 aa  176  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 		 833 aa  175  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.88 
 
 		 838 aa  172  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.47 
 
 		 831 aa  171  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.63 
 
 		 715 aa  170  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 1180 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 694 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.4 
 
 		 900 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.29 
 
 		 754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.95 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 798 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 795 aa  166  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 795 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.02 
 
 		 851 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 848 aa  164  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 858 aa  163  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.18 
 
 		 732 aa  163  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.31 
 
 		 748 aa  163  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.22 
 
 		 896 aa  163  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 		 858 aa  161  8e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.64 
 
 		 731 aa  161  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.25 
 
 		 825 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.31 
 
 		 725 aa  159  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.75 
 
 		 806 aa  159  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 731 aa  158  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.41 
 
 		 797 aa  158  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 833 aa  157  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.65 
 
 		 817 aa  157  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.3 
 
 		 765 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.04 
 
 		 762 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.83 
 
 		 751 aa  156  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.11 
 
 		 751 aa  157  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 744 aa  157  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.82 
 
 		 786 aa  156  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 790 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 		 783 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 1060 aa  156  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 816 aa  155  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 742 aa  155  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 668 aa  155  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 793 aa  154  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 646 aa  154  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.69 
 
 		 718 aa  154  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.36 
 
 		 783 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.5 
 
 		 730 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 826 aa  154  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.52 
 
 		 855 aa  153  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.49 
 
 		 786 aa  153  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 707 aa  153  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 743 aa  153  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.46 
 
 		 787 aa  153  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.29 
 
 		 892 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.58 
 
 		 781 aa  152  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.52 
 
 		 724 aa  152  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 		 753 aa  151  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.44 
 
 		 741 aa  151  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 809 aa  151  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>