82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2249 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  100 
 
 
916 aa  1870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  88.42 
 
 
918 aa  1652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  27.98 
 
 
1017 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.54 
 
 
1324 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.85 
 
 
1500 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.14 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.71 
 
 
1000 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  27.78 
 
 
992 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  27.81 
 
 
843 aa  72.4  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.68 
 
 
1314 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  27.15 
 
 
897 aa  71.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.01 
 
 
1309 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  23.97 
 
 
1261 aa  68.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  28.86 
 
 
934 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  27.68 
 
 
859 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.37 
 
 
1550 aa  67  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.43 
 
 
838 aa  65.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  25.13 
 
 
1523 aa  64.7  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.04 
 
 
801 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.34 
 
 
1056 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 
1311 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  29.94 
 
 
1509 aa  62.4  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
911 aa  61.2  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  23.64 
 
 
845 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
1138 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
785 aa  60.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1088 aa  58.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  26.12 
 
 
373 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
814 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
671 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  22.65 
 
 
1383 aa  58.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  24.24 
 
 
392 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
640 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.95 
 
 
713 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  26.75 
 
 
900 aa  56.2  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.14 
 
 
1185 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.76 
 
 
822 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
1125 aa  54.7  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.81 
 
 
1228 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
652 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  26.75 
 
 
1326 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  28.21 
 
 
983 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  28.85 
 
 
964 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  25.93 
 
 
385 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  28.3 
 
 
715 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  27.68 
 
 
965 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  23.67 
 
 
849 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.24 
 
 
1068 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
462 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.05 
 
 
992 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  22.3 
 
 
2413 aa  50.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 
1108 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  20.95 
 
 
1044 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  26.26 
 
 
919 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  32.23 
 
 
1427 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  27.25 
 
 
829 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
857 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
953 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
924 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  24.42 
 
 
1014 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  20.11 
 
 
1438 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  27.65 
 
 
958 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
1105 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  29.66 
 
 
956 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  24.5 
 
 
899 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  26.89 
 
 
654 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  20.06 
 
 
1039 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  27.07 
 
 
990 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
755 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 
1033 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  24.58 
 
 
995 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 
666 aa  45.8  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 
941 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1345  HPr kinase  22.73 
 
 
473 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.42 
 
 
1146 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  28.51 
 
 
806 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 
680 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.29 
 
 
680 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  33.68 
 
 
1468 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  25.75 
 
 
775 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  26.07 
 
 
513 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
776 aa  44.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>