71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3865 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  100 
 
 		 341 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  61.47 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  61.47 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  61.47 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  49.7 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  45.95 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  55.11 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  47 
 
 		 546 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  46.88 
 
 		 351 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  42.49 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  40.29 
 
 		 345 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  33.62 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  37.42 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  26.26 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  25.17 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  29.2 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.38 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25.77 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.91 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  26.94 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  21.94 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  26.51 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  24.56 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  24.07 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 424 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  28.87 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  25.48 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  24.56 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  23.89 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  23.94 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  30.47 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  23.55 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  23.72 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  38.33 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  22.84 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  23.88 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  29.27 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  29.27 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  26.34 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.22 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.71 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  35.78 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  26.83 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  35.78 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  35.78 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  20.88 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  29.81 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.24 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  33.01 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>