More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1926 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  36.92 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0234  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.07 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.22 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.8 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 419 aa  67.4  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 		 435 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.99 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.62 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  37.74 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.74 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0116  cyclic nucleotide-binding protein  33.08 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.69 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.01 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 243 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  36.63 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  35 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.68 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  25.53 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.94 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.84 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.86 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  27.78 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.66 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.01 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  37.37 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.23 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.37 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.02 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  25.74 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  26.12 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 512 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 563 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.68 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  27.08 
 
 		 410 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  27.69 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>