More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2013 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.75 
 
 		 586 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  63.82 
 
 		 607 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  63.82 
 
 		 607 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  64.03 
 
 		 594 aa  745    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  58.3 
 
 		 583 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 574 aa  1169    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.11 
 
 		 586 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  60.57 
 
 		 582 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  56.56 
 
 		 585 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  53.91 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  51.6 
 
 		 582 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.74 
 
 		 584 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.38 
 
 		 579 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  52.47 
 
 		 582 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  51.54 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  51.65 
 
 		 585 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  50.19 
 
 		 614 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  51.54 
 
 		 584 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.79 
 
 		 599 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  49.26 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  48.48 
 
 		 630 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  49.1 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.15 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  49.63 
 
 		 600 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.79 
 
 		 625 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  47.79 
 
 		 625 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  48.61 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  47.15 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  41.23 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  41.98 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  38.52 
 
 		 515 aa  372  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 		 593 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.88 
 
 		 682 aa  354  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 579 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  38.83 
 
 		 696 aa  331  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  35.93 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  38.11 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 646 aa  312  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.47 
 
 		 656 aa  266  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.43 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 654 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.06 
 
 		 583 aa  248  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.78 
 
 		 657 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 660 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 578 aa  242  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 570 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 580 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.6 
 
 		 579 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  33.33 
 
 		 579 aa  234  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 582 aa  233  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 590 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.16 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.42 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 582 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.5 
 
 		 581 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29.69 
 
 		 577 aa  227  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 654 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 578 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.29 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 595 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.59 
 
 		 614 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 583 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 614 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 575 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 		 624 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 570 aa  220  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  31.62 
 
 		 605 aa  220  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 645 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  32.41 
 
 		 595 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 578 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  32.21 
 
 		 600 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.42 
 
 		 622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 613 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.4 
 
 		 646 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  32.42 
 
 		 580 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  30.53 
 
 		 577 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  28.98 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 578 aa  216  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>