More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1563 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  100 
 
 		 147 aa  296  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  78.79 
 
 		 159 aa  216  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  76.34 
 
 		 146 aa  214  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  69.33 
 
 		 151 aa  196  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  60.98 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  49.02 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  50.39 
 
 		 232 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  48.67 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  46.85 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  49.52 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  47.62 
 
 		 197 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  46.94 
 
 		 268 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  50 
 
 		 202 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  44.54 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  38.84 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 205 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  41.73 
 
 		 217 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  49.41 
 
 		 203 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 202 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  39.68 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  42.28 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  40 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  40.15 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  40 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  39.06 
 
 		 499 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  39.06 
 
 		 499 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  39.17 
 
 		 510 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  41.9 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.48 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  42.34 
 
 		 520 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  42.34 
 
 		 520 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  42.34 
 
 		 516 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  43.43 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  43.43 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  43.43 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  43.43 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  44.55 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  46.53 
 
 		 479 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  43 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  38.1 
 
 		 577 aa  76.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.76 
 
 		 601 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.33 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  38.52 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  41.94 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  37.82 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  43.69 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 669 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  31.34 
 
 		 728 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  40.7 
 
 		 274 aa  67  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.82 
 
 		 1068 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  29.1 
 
 		 773 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.04 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.52 
 
 		 675 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  39.36 
 
 		 407 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.52 
 
 		 1055 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.91 
 
 		 726 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  36.17 
 
 		 675 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.82 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  38.94 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  38.94 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 712 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.07 
 
 		 439 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.56 
 
 		 759 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.36 
 
 		 575 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.04 
 
 		 338 aa  60.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.28 
 
 		 699 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.43 
 
 		 773 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  31.3 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  35.66 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  36.89 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.89 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 		 762 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.92 
 
 		 334 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.69 
 
 		 689 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 587 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 		 852 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  33.09 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.89 
 
 		 531 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.17 
 
 		 415 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.34 
 
 		 335 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  33.68 
 
 		 694 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  33.68 
 
 		 721 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.62 
 
 		 433 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>