More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2020 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 800 aa  1606    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 793 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 659 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 		 535 aa  389  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1329 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 543 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 807 aa  261  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 903 aa  257  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.66 
 
 		 625 aa  253  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 		 464 aa  251  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 608 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.3 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.09 
 
 		 466 aa  235  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.22 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52 
 
 		 659 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 		 628 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 593 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  43.89 
 
 		 605 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 592 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 1226 aa  157  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  44.51 
 
 		 1101 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1229 aa  152  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 477 aa  148  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  34.23 
 
 		 965 aa  141  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.49 
 
 		 1568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.09 
 
 		 1184 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 873 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.09 
 
 		 1425 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 737 aa  105  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  36.68 
 
 		 387 aa  105  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  34.32 
 
 		 588 aa  104  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 858 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 456 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.73 
 
 		 843 aa  100  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 516 aa  99.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 711 aa  97.8  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 991 aa  97.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 683 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 437 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1168 aa  94.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 606 aa  94  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 711 aa  94  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 786 aa  93.2  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 708 aa  92.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 543 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 412 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.09 
 
 		 637 aa  92  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.35 
 
 		 1181 aa  91.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 592 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 385 aa  91.3  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 592 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 844 aa  90.9  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.24 
 
 		 1267 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  27.05 
 
 		 897 aa  90.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.18 
 
 		 844 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 556 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3296  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.18 
 
 		 844 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 779 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  26.41 
 
 		 617 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 678 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 473 aa  89  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.63 
 
 		 1442 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 386 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  28.18 
 
 		 908 aa  89.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 502 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  28.16 
 
 		 600 aa  88.6  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.05 
 
 		 1557 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 704 aa  88.6  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 1079 aa  87.8  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  27.88 
 
 		 908 aa  87.8  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  28.27 
 
 		 908 aa  87.8  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 592 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 975 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 492 aa  87  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1021 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 		 1362 aa  87  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.97 
 
 		 1959 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 401 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.4 
 
 		 951 aa  86.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  28.24 
 
 		 915 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 899 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 838 aa  86.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  20.25 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 1140 aa  86.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 467 aa  86.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 749 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  26.78 
 
 		 910 aa  85.9  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 940 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.64 
 
 		 1303 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 		 1721 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>