101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1209 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  26.47 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  30.22 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  32.65 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  27.93 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  32.74 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  30.13 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  29.5 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  27.01 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  22.99 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  27.56 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  31.2 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  32.86 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  26.59 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  31.78 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  35.53 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 742 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.41 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  33.75 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  27.7 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 350 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  24.43 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  20.83 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  37.29 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  38.98 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  29.91 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.7 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 373 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  25.88 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  22 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  33.33 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  38.18 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  31.46 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  24.32 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  28.57 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  37.35 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  22.02 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  32.2 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 357 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  32.86 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>