89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0370 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  63.3 
 
 
307 aa  343  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  62.26 
 
 
275 aa  341  9e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  59.62 
 
 
304 aa  340  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  56.23 
 
 
266 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  57.74 
 
 
268 aa  321  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  58.87 
 
 
266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  58.17 
 
 
332 aa  315  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  52.45 
 
 
266 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  45.92 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.85 
 
 
272 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.85 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  43.15 
 
 
269 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.73 
 
 
301 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  37.69 
 
 
272 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  36.4 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  38.46 
 
 
425 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  41.78 
 
 
415 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40.79 
 
 
415 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.11 
 
 
254 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.91 
 
 
415 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  35.96 
 
 
424 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  36.14 
 
 
257 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  34.4 
 
 
255 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.43 
 
 
256 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.6 
 
 
274 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.6 
 
 
286 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.59 
 
 
269 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.73 
 
 
269 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  28.04 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.81 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  26.89 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.62 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.98 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.03 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25.55 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  30.63 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.59 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.59 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.45 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.69 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  46.27 
 
 
105 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30 
 
 
568 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.25 
 
 
572 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.36 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  35.65 
 
 
568 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  36.67 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.91 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  35.56 
 
 
229 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  41.51 
 
 
228 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.56 
 
 
229 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.56 
 
 
229 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.47 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  41.51 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  39.62 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  30.95 
 
 
1473 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.48 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.97 
 
 
553 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.77 
 
 
670 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  35.56 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.65 
 
 
228 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  30.63 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.26 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  26.77 
 
 
1465 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  34.26 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  33.83 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.48 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.78 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  23.46 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  28.82 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  33.7 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  27.69 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.33 
 
 
1518 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  34.07 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  27.69 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  29.13 
 
 
1480 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  31.76 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.35 
 
 
659 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.36 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  28.49 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.07 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.07 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  23.66 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  25.29 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.64 
 
 
250 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.85 
 
 
1479 aa  42  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.03 
 
 
238 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.48 
 
 
1521 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>