177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2969 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  99.01 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  88.61 
 
 		 201 aa  333  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.18 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  64 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  65 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.7 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  40.13 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  38.22 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  35.47 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  36.94 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  34.19 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  34.19 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 307 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  32.89 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  40.16 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.5 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  39.66 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 628 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.9 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1096 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 3560 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  27.42 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  31.65 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 574 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 605 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 1421 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 4079 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 289 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 562 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 389 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.27 
 
 		 730 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 361 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.12 
 
 		 417 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.65 
 
 		 577 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 732 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 621 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 556 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.37 
 
 		 479 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 597 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 594 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 538 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 695 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 357 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.56 
 
 		 882 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.51 
 
 		 462 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1827 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 1056 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 373 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1192 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  35.63 
 
 		 784 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 284 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  30.59 
 
 		 336 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 3145 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 301 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 428 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.4 
 
 		 882 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  38.46 
 
 		 607 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 607 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>