102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1603 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  100 
 
 		 557 aa  1131    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  55.65 
 
 		 566 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  55.65 
 
 		 566 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  53.06 
 
 		 573 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  45.21 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  45.21 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  47.83 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  43.59 
 
 		 573 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  45.21 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  43.42 
 
 		 573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  45.29 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  45.21 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  45.03 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  45.03 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  43.78 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  43.68 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  42.94 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  44.77 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  42.83 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  40.29 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  24.3 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  26.54 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  24.72 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  25.05 
 
 		 535 aa  106  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  23.72 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  23.55 
 
 		 565 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  23.34 
 
 		 530 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  23.65 
 
 		 581 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.16 
 
 		 577 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.54 
 
 		 577 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  21.3 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  23.77 
 
 		 849 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  22.86 
 
 		 535 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  26.12 
 
 		 552 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.28 
 
 		 564 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  24.52 
 
 		 574 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.69 
 
 		 562 aa  90.5  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.9 
 
 		 591 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  23.59 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.69 
 
 		 590 aa  90.5  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  23.65 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  25.26 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  24.75 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  22.57 
 
 		 581 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  23.93 
 
 		 574 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  22.8 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  25.91 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  22.69 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  22.25 
 
 		 535 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.36 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  21.7 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  22.67 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  21.49 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.84 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  25.88 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  22.7 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  24.03 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.44 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.35 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22.49 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.5 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.27 
 
 		 553 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.1 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.1 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  21.65 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.11 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  22.27 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  22.73 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.93 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  22.13 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  23.79 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.37 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.37 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  23.37 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  21.23 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.27 
 
 		 602 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  28.88 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  22.78 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  30.12 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.47 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.86 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  25.56 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  19.61 
 
 		 563 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  19.61 
 
 		 563 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.61 
 
 		 602 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  23.51 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  22.17 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  21.23 
 
 		 580 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  20.16 
 
 		 565 aa  50.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  20.49 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  20.49 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  20.49 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  23.94 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  19.22 
 
 		 570 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  21.89 
 
 		 606 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  21.89 
 
 		 606 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  19.9 
 
 		 555 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>