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for query gene Mboo_1566 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1566  major facilitator transporter  100 
 
 
483 aa  948    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 
497 aa  190  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  28.57 
 
 
498 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 
465 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 
501 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 
477 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
482 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 
477 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.04 
 
 
462 aa  171  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 
474 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 
487 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 
486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.07 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 
493 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 
495 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.63 
 
 
462 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 
480 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 
478 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.49 
 
 
464 aa  156  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
482 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 
458 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.21 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  28.47 
 
 
474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
460 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 
522 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 
483 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 
483 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 
482 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 
461 aa  143  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  26.75 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  29.89 
 
 
476 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 
511 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
456 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  27.91 
 
 
477 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
493 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 
471 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 
474 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  28.16 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.73 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.45 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.83 
 
 
470 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  30.17 
 
 
477 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.38 
 
 
492 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 
457 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  27.12 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 
529 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.17 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.29 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
573 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
476 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 
478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.53 
 
 
494 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  28.21 
 
 
455 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  28.21 
 
 
455 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  28.21 
 
 
455 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  28.21 
 
 
455 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
478 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 
521 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.23 
 
 
478 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
445 aa  127  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  27.71 
 
 
455 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 
529 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 
478 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 
508 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
478 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  26.05 
 
 
508 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 
579 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  28.69 
 
 
491 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
528 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  25.35 
 
 
465 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 
505 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  26.54 
 
 
467 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  28.39 
 
 
562 aa  124  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 
478 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
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NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.22 
 
 
455 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  27.1 
 
 
455 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.22 
 
 
455 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
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