141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1158 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  62.66 
 
 
253 aa  295  6e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  55.19 
 
 
248 aa  275  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  56.49 
 
 
246 aa  271  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  60 
 
 
259 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  51.04 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  47.74 
 
 
251 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  50.22 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  50.44 
 
 
252 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  46.52 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  45.73 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  47.11 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  46.28 
 
 
252 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  46.96 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  46.4 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  39.26 
 
 
251 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  46.93 
 
 
256 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  42.24 
 
 
257 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  44.3 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  39.75 
 
 
236 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  41.25 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  48.35 
 
 
203 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  43.12 
 
 
382 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  43.35 
 
 
242 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  38.57 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  37.17 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  36.09 
 
 
207 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  33.91 
 
 
221 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  36.5 
 
 
225 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  37.36 
 
 
239 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  37.36 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  34.46 
 
 
202 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  36.41 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  38.46 
 
 
235 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.68 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  34.62 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  35.14 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  31.84 
 
 
371 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  30.39 
 
 
189 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  28.87 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  29.28 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.64 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.63 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.85 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  30.04 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.32 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.46 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.67 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28.63 
 
 
523 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  34.35 
 
 
363 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.25 
 
 
475 aa  78.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.28 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30.58 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30.58 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.31 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  34.1 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.83 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.16 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.81 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  37.78 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  37.78 
 
 
551 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  29.17 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  34.01 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  28.44 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.32 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  26.29 
 
 
471 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.75 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  31.39 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.78 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  29.93 
 
 
529 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  32.61 
 
 
564 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  28.21 
 
 
492 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  35.2 
 
 
354 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  28.97 
 
 
547 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.25 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  27.46 
 
 
556 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.29 
 
 
530 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.91 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  30.05 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  27.7 
 
 
518 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  32.84 
 
 
559 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  25.75 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  24.9 
 
 
3021 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  25.63 
 
 
533 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  26.24 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  30.15 
 
 
546 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.19 
 
 
656 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.13 
 
 
202 aa  55.8  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  28.23 
 
 
518 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  24.32 
 
 
502 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  24.22 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  28.68 
 
 
532 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  27.17 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  24.49 
 
 
1514 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  27.39 
 
 
602 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  25.97 
 
 
2454 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  28.08 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  24.61 
 
 
3002 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  27.51 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>