162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3456 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 280 aa  553  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  51.08 
 
 		 271 aa  268  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.04 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.56 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.37 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.37 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.62 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.91 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.52 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.37 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.02 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.15 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.54 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.77 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.78 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.68 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.17 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.95 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.38 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.88 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.77 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.09 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.53 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.38 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.31 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.4 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.04 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.06 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.09 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.98 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  25.37 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.51 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.82 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.75 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  36.67 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  26.69 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  25.18 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  22.63 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.69 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  32.48 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.98 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.68 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.3 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.58 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  24.81 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.82 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.02 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.57 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  28.52 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.51 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.59 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.63 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.2 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  28.86 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.05 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.4 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.45 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.82 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  28.79 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.61 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.57 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.63 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.77 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.6 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.83 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.11 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.41 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  26.59 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  29.2 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.8 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.62 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  26.59 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.27 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.35 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  24.86 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  23.6 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.11 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.28 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  26.72 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  24.05 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  21.43 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.73 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.7 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  24.42 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>