241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0468 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  68.67 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  65.67 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  68.24 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  70.49 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  60.25 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.59 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  32.9 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.8 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.46 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  31.54 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.75 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.06 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.66 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.66 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.37 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  34.31 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  32.78 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.33 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.68 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.16 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.63 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.03 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  32.42 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.03 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.03 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.03 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.63 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.63 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.63 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  32.37 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.63 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.55 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.55 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  34 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.64 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.88 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.55 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.9 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.86 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.63 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.98 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.81 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  36.93 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.55 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.28 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.33 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.44 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.37 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.69 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.44 
 
 		 224 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  31.85 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  40.35 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  30.36 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.12 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  31.88 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  36.82 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.92 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  31.35 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  30.65 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.47 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  26.81 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  35.96 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.85 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.91 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>