249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0645 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  53.66 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.15 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  38.4 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.35 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.82 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.54 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.2 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.84 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.31 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.09 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.31 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.03 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.05 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.12 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.05 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.1 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.51 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.75 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.32 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.33 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.68 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.25 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.52 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.33 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  30.42 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.02 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.73 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.63 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.49 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  31.3 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  29.46 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.66 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.38 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.84 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  26.94 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.89 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.34 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.39 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.03 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.93 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.76 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.46 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.95 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.64 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.73 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.07 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  31.36 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  31.36 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  31.36 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.12 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.53 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.81 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  27.24 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.57 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  29.78 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.97 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.45 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.88 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  28.11 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.18 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  28.75 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  29.17 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  28.75 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  28.03 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.51 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.86 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>