241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1467 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.91 
 
 
253 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.93 
 
 
254 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  36.93 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.96 
 
 
261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  34.33 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
248 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
251 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
268 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.91 
 
 
251 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.13 
 
 
268 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.44 
 
 
249 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.93 
 
 
262 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  34.05 
 
 
250 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  35.81 
 
 
264 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 
242 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
251 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.55 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  40 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  40.32 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.07 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.61 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.31 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.04 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  33.89 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.06 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.39 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  33.91 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.24 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.12 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.87 
 
 
256 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.26 
 
 
251 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.87 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  29 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.9 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  34.15 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.88 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.65 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  29.34 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.28 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.17 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.65 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  35.88 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  31.17 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.32 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  33.62 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.18 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.18 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.18 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.6 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.6 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.17 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.71 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.5 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.05 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.45 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.7 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.71 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.16 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.13 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.15 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.37 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.34 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  28.97 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.49 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  29.05 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.6 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.8 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.98 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.34 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.75 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.88 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.35 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.28 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.4 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  35.53 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.71 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.94 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>