238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1291 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  98.41 
 
 		 251 aa  480  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  34.44 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.91 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.13 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.34 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.41 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.9 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.63 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.72 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.28 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.61 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.69 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.26 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.75 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.75 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  32.84 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  24.7 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.57 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.27 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.44 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.75 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  21.37 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.38 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.31 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.59 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.41 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.25 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.11 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.91 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.78 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.79 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.84 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  24.21 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.81 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.55 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  21.2 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.89 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  35.34 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  25.98 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.37 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.05 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.69 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  23.72 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.98 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.98 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  27.69 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.98 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.83 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.43 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.98 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.93 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  25.34 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.27 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  26.12 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.71 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.26 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.79 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  30.58 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.38 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.11 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.96 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  26.32 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.29 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  24.8 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.43 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.58 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  33.18 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  24.58 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.81 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.21 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>